1. 基本思路

　　强化实施科技兴新的基本思路是：抓住"四个重点"，实施"四大工程"，突出"七个强化"，实现"五个带动"。

   “四个重点”是：科技兴农，科技兴工，科技兴贸，以科技为先导的矿产资源开发与环境保护。

   “四大工程”是：产品名牌创建工程，科技兴新标志性工程，区域支柱产业培育工程，科技兴新素质工程。

   “七个强化”是：强化对科技兴新的领导，强化对科技兴新的资金投入，强化区域创新体系建设，强化人力资源开发，强化科技基础设施建设，强化同区外的交流与合作，强化知识产权保护。

   “五个带动”是：加强观念创新和制度创新，带动科技兴新的工作创新；优先推动天山北坡经济带的科技创新和科技进步，以天山北坡经济带的率先快速发展带动全区的发展；大力开展创建全国或自治区科技进步先进县市区和自治区科技兴新先进行业厅局的活动，带动区域和行业的科技进步与经济发展；加强高新技术产业开发和"一区多园"建设，带动高新技术开发、应用和产业化；利用在西部大开发中一批重大科技项目的实施，带动全区的科技进步与经济振兴。

　　2. 目标

　　--深化科技体制改革，完成科研院所体制与机制的转变，建立起以企业为主体、产学研相结合的技术创新体系，以科研机构、高等学校为主的知识创新体系，以及社会化的科技服务体系，使科技力量布局和科技资源配置得到优化，科技基础设施基本完善。

　　--科技投入明显增长，全社会科学研究与试验发展经费占全区国内生产总值的比例提高到1.5%，科技拨款占地方财政支出比例达到3%。企业技术开发经费占年销售收入的比例，一般企业达1%以上，大中型企业达2%以上，高新技术企业达到3-5%。

　　--通过技术引进、技术创新，利用高新技术改造传统产业，使主要行业技术与装备达到发达国家90年代中期水平，自治区的骨干企业的关键技术与装备达到或接近发达国家90年代末期水平，部分优势企业接近或达到当时的国际先进技术水平。

    --在信息技术、生物技术、新能源技术、先进制造技术、新型环保技术等领域取代一批具有竞争力的科技成果，开发一批高新技术产业，培育3~5个高新技术产业，大幅度提高高新技术产业增加值和高新技术产品出口额在工业增加值和产品出口总额中的比重。

　　--重点部署实施科技攻关、科技示范、科技成果产业化工程，促进10个以上年产值超10亿元的优势产业和10多个年产值超亿元的高新技术企业的形成与发展，为到2010年全区国内生产总值比2000年翻一番以上作出贡献。

　　--以水资源有效利用、荒漠化和盐渍化防治、天然植被保护与恢复为重点，依靠科学技术加强生态建设与环境保护，使"一河两湖"（塔里木河、博斯腾湖、艾比湖）流域、干线公路铁路沿线、绿洲边缘、矿产开发带的环境污染和生态破坏加剧的趋势得到基本控制，部分地区的环境质量有所改善，建成若干个经济快速发展、环境清洁优美、生态良性循环的示范区和示范城市。