阿勒泰地区水环境监测分中心2004年依据《中华人民共和国计量法》、《产品质量检验机构计量认证管理办法》的有关规定评审考核,取得国家认证认可监督管理委员会颁发的(2005)量认国字(G1282-2)号《中华人民共和国计量认证合格证书》。
按照水利部《水文、水资源调查评价资格认证管理暂行办法》,经过资格认证,取得乙级《水文、水资源调查评价证书》。